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SPYfighting/deepseek-science

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🧪 Science team workbench for DeepSeek Harness — 9-role research agents, paper-blueprint workflow, task-flow DAG, DB/SSH/figures toolchains

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🧪 dsh-science — DeepSeek Harness 科研工作台插件

Science team workbench for DeepSeek Harness — 一个把 DeepSeek Harness 变成科研团队协作平台的插件:9 个专业科研角色(鲸鱼娘吉祥物)由队长统一调度,围绕文章蓝图(核心主张 → Results → Tasks → 图表证据)自主推进科研工作。

License: MIT dsh-plugin Version

English | 中文

What it does

Turn a DeepSeek Harness session into a science team captain backed by 9 specialist agents (literature scout, topic designer, data analyst, simulator, model trainer, figure expert, writer, reviewer, presentation expert). The captain dispatches all research work to members, tracks it on a shared task board, and defaults to dispatching a reviewer after every execution task. Everything revolves around a Paper Blueprint: a core claim supported by 3–5 Results, each backed by tasks and figures — negative results trigger blueprint reassessment (adjust or falsify).

  • 任务流 DAG(团队 tab):成员鲸鱼娘吉祥物按动作姿态展示(working/thinking/离线灰度),任务节点按状态分列、依赖箭头相连、点击看详情
  • 文章框架 tab:核心 → Results → 任务/图表 的框架图 + 列表视图,五态状态流转,负面结果证伪风险提示
  • 产物 tab:登记图表预览、工作区文件树、SSH 主机与作业、审查记录
  • 工具链:SQLite/PostgreSQL/MySQL 只读优先查询(写操作审批)、SSH 远程作业引擎(Slurm/直发、收割、诊断)、科学绘图规范(Python/R 出版级)、文献检索与 DOI 核验、通用模拟工具上手规范(8 步)与 5 个内置工具档案
  • 角色技能库:每角色 ≤3 个精选开源 skill 仓库,勾选即装、仅本插件对应角色可用(严格隔离),支持自定义仓库链接
  • 安全:文件路由防路径穿越、写操作与远程操作审批、凭据不进模型上下文

Install

Requires DeepSeek Harness ≥ 0.2.0 < 0.3.0(在 0.2.2-rc.1 web 与官方桌面版 0.2.2-rc.1 上测试通过)。

# Web / CLI(web profile)
dsh plugin --profile web add SPYfighting/deepseek-science

# 或在应用插件页:添加插件 → 填入 SPYfighting/deepseek-science

然后重启 Harness。右栏「开始」页出现科研工作台胶囊,会话内 /sci-* 命令可用。

桌面版说明:

  • 团队/文章框架/产物 三标签与全部团队工具均可用(桌面内嵌同一 Web UI)
  • 依赖 ssh2 含可选原生构建脚本——桌面插件管理器会请求批准一次构建(标准社区插件流程),批准后 SSH 功能完整;不批准则 SSH 模块退化为纯 JS 实现
  • 工作台数据面板(HTTP 轮询)在桌面版降级为提示文案(桌面无 webServer,属平台约束);团队协作页、任务板与全部工具不受影响

npm 包即将发布;当前 GitHub git 安装是完整支持的官方路径(支持 dsh plugin add github:SPYfighting/deepseek-science)。

Quick start

  1. 打开右栏 科研工作台 → 团队 tab → 勾选生成你的团队(或让队长 sci_team_spawn_all)
  2. 对队长说你的科研目标(如"分析 demo.db 的差异表达基因并写摘要")——队长会建蓝图、拆 Results、派任务给成员
  3. 文章框架 tab 实时展示 核心→Results→任务 的对齐与覆盖状态
  4. 任意时刻 /sci-review 审查最近一轮工作(数字溯源/图文一致/伪造检测)

Documentation

  • 功能规格说明书 · 开发日志 · agent-teams 协作配方

License

MIT — 见 LICENSE。吉祥物与 UI 模式向 dsh-agent-teams(MIT)与 dsh-superagent-prototype(MIT)致谢;绘图/写作/模拟技能设计参考 AcademicForge(MIT)、K-Dense scientific-agent-skills(MIT)、nature-skills、PaperSpine、ARS academic-research-skills(CC-BY-NC 4.0,仅设计思想参考,未复制文本)。


中文说明

dsh-science 是一个 DeepSeek Harness 科研工作台插件:9 个专业科研角色(文献调研、课题设计、数据分析、计算模拟、模型训练、科研绘图、文章撰写、科研审查、汇报PPT)组成团队,由队长统一调度,围绕文章蓝图(核心主张 → 3-5 个 Results → Tasks → 图表证据)推进科研工作。负面结果自动触发蓝图重评甚至证伪流程。

核心功能

模块 说明
团队 DAG 成员吉祥物动作姿态 + 任务状态三列流 + 依赖箭头 + 点击详情
文章框架 核心→Results→任务/图表 框架图与列表视图、五态流转、证伪风险提示
产物 登记图表预览、工作区文件树、SSH 主机与作业、审查记录
数据库 SQLite/PostgreSQL/MySQL,只读守卫 + 写审批
SSH 远程计算 探测/提交/监控/收割,Slurm 与直发双模式,断连安全
自动审查 数字溯源/断言-执行一致/图文一致/引用卫生/伪造检测,fail 自动要求修正
角色技能库 每角色 ≤3 精选开源 skill 仓库,勾选安装,角色间严格隔离
通用模拟规范 新工具 8 步上手协议(版本核验→手册→冒烟→见证→生产→诊断→dossier)

设计参考(致谢)

  • agent-teams(MIT)— 团队协作页面模式与鲸鱼娘吉祥物形式
  • dsh-superagent-prototype(MIT)— Router/Worker 双层架构思想
  • AcademicForge(MIT)— Claude Science 计算技能移植版的验证阶梯与诊断表
  • K-Dense scientific-agent-skills(MIT)— 工具档案模式
  • OpenAI4S / openscience / PaperSpine / ARS / nature-skills — 论文蓝图方法论
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Verified DSH bundle

Commit 780a7ae96480

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